MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009051	T	6	6	2452182	2452187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_009051	TCC	2	6	2452944	2452949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_009051	GCCTG	2	10	2452954	2452963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6504	NC_009051	GCC	2	6	2453022	2453027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6505	NC_009051	GCC	2	6	2453042	2453047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_009051	GGA	2	6	2453055	2453060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_009051	GGA	2	6	2453099	2453104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_009051	AT	3	6	2453109	2453114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_009051	AGA	2	6	2453121	2453126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_009051	AGG	2	6	2455195	2455200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_009051	T	9	9	2455728	2455736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_009051	GCC	2	6	2455738	2455743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_009051	GCG	2	6	2455751	2455756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_009051	A	6	6	2458105	2458110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_009051	TGT	2	6	2458118	2458123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_009051	GA	3	6	2458214	2458219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_009051	CGC	2	6	2458220	2458225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_009051	GGC	2	6	2458242	2458247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_009051	AGG	2	6	2460510	2460515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_009051	CGG	2	6	2460887	2460892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_009051	TCT	2	6	2460914	2460919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_009051	AGT	2	6	2460946	2460951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_009051	ATT	2	6	2460953	2460958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_009051	TAT	2	6	2461001	2461006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_009051	AAG	2	6	2461032	2461037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_009051	GAA	2	6	2463208	2463213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_009051	CG	3	6	2463219	2463224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6528	NC_009051	TTC	2	6	2463277	2463282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_009051	TCCGT	2	10	2463358	2463367	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6530	NC_009051	GCG	2	6	2463408	2463413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_009051	CGC	2	6	2463436	2463441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6532	NC_009051	GCC	2	6	2463488	2463493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6533	NC_009051	C	6	6	2463520	2463525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6534	NC_009051	CTC	2	6	2465769	2465774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_009051	CAG	2	6	2465779	2465784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_009051	CTTCT	2	10	2465788	2465797	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6537	NC_009051	ACC	2	6	2465810	2465815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_009051	CCGG	2	8	2465832	2465839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_009051	CGG	2	6	2465842	2465847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_009051	GA	4	8	2465854	2465861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_009051	GGCG	2	8	2468581	2468588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6542	NC_009051	GAT	2	6	2468591	2468596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_009051	G	6	6	2468606	2468611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_009051	G	6	6	2468863	2468868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_009051	AGG	2	6	2469285	2469290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_009051	CGG	2	6	2469666	2469671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_009051	CAA	2	6	2469682	2469687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_009051	TGCC	2	8	2469692	2469699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6549	NC_009051	ACA	2	6	2469985	2469990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_009051	G	6	6	2469995	2470000	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_009051	G	6	6	2470737	2470742	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_009051	TTA	2	6	2470922	2470927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_009051	AG	3	6	2471981	2471986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_009051	GAA	2	6	2471995	2472000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_009051	AGG	2	6	2473773	2473778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_009051	GACC	2	8	2474344	2474351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_009051	CGA	2	6	2477084	2477089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_009051	T	8	8	2477091	2477098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_009051	TTG	2	6	2477127	2477132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_009051	TTC	2	6	2477660	2477665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_009051	CGC	2	6	2477760	2477765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6562	NC_009051	GGA	2	6	2477777	2477782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_009051	G	6	6	2477790	2477795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_009051	CT	3	6	2477960	2477965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_009051	CGG	2	6	2477968	2477973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_009051	ATCG	3	12	2477974	2477985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6567	NC_009051	CCCTG	2	10	2478025	2478034	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6568	NC_009051	CT	3	6	2478080	2478085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.